هر ساله با فرارسیدن فصل پاییز پرندگان مهاجر تالاب میقان اراک را برای زیست گاه خود انتخاب می کنند. اما هر از چندگاهی شیوع برخی از بیماری ها نگرانی ها را در بین مردم و مسئولان به وجود می آورد. یکی از شایع ترین این بیماری های ویروسی شیوع آنفلوآنزای فوق حاد پرندگان است بیماری که در سال ۹۵ بیش از 2400 پرنده را تلف کرد. سال 96 نیز این بیماری در کمین تالاب میقان و پرندگان بود که خوشبختانه از شیوع آن جلوگیری شد‌. و در سال 1397 و 1398 نیز هیچ موردی از وجود این بیماری گزارش نشد، اما ظاهرا امسال مجدد شاهد شیوع این بیماری هستیم . به همین رو از همان روزهای ابتدای مشاهده لاشه پرندگان در تالاب میقان ادره کل محیط زیست در کنار دامپزشکی استان مرکزی به میدان آمدن تا از تلفات این پرندگان جلوگیری کنند.