به گزارش برنا، متن پیام تسلیت حجت الاسلام والمسلمین دکتر حسن روحانی به این شرح است:
انا لله و انا الیه راجعون
إِذَا مَاتَ اَلْمُؤْمِنُ اَلْفَقِیهُ ثُلِمَ فِی اَلْإِسْلاَمِ ثُلْمَةٌ لاَ یَسُدُّهَا شَیْءٌ
رحلت عالم مجاهد حضرت آیت الله جلالی خمینی، موجب تأثر و تالم خاطر شد.
این روحانی انقلابی که از مبارزان بنام در نهضت اسلامی و از نزدیکان امام خمینی(ره) و نیز از علمای فعال شرق تهران بودند، در جایگاه های مختلف خدمتگزاری ازجمله در سنگر امامت جمعه شهر خمین با ارائه خدمات فراوان فرهنگی و اجتماعی، تمام عمر پر برکت خود را صرف ترویج مکتب اهل بیت (ع)، تحقق آرمان‌های نظام اسلامی و خدمت به مردم کرد.
اینجانب این ضایعه را به حوزه‌های علمیه، شاگردان، مردم شریف استان مرکزی، بیت مکرم آن مرحوم به ویژه فرزندان بزرگوارشان حجج اسلام محمد رضا و مهدی جلالی خمینی تسلیت می‌گویم و از درگاه خداوند رحمان برای آن عالم وارسته رحمت و رضوان و برای عموم بازماندگان صبر و اجر مسألت دارم.
حسن روحانی
رئیس جمهوری اسلامی ایران