به گزارش برنا، متن پیام آیت الله دکتر سید ابراهیم رئیسی به این شرح است:
بسم‌الله الرحمن الرحیم
انا لله و انا الیه راجعون
رحلت حضرت آیت‌الله سید فخرالدین موسوی، نماینده فقید مردم اردبیل در مجلس خبرگان رهبری، موجب تأثر و تألم خاطر گردید.
این عالم پارسا در کنار فعالیت‌های علمی و ترویج معارف اسلامی، در مسئولیت‌های متعدد سیاسی از جمله سه دوره نمایندگی مردم اردبیل در مجلس شورای اسلامی همواره نقش آفرین بود و در عرصه فعالیت های فرهنگی و اجتماعی نیز با تاسیس مراکز علمی و دینی خدمات ارزنده‌ای به یادگار گذاشت که ثمرات آن در جامعه ماندگار و ذخیرة اخروی ایشان خواهد شد.
اینجانب ضایعة فقدان این عالم وارسته را به حوزه‌های علمیه، شاگردان، علاقه‌مندان به‌ویژه بیت مکرم و سایر بازماندگان آن مرحوم تسلیت می‌گویم و از درگاه خداوند متعال برای ایشان علو درجات و همنشینی با اجداد طاهرینش را مسألت دارم.
سیدابراهیم رئیسی
رئیس جمهوری اسلامی ایران