مرکز ملی پرورش استعدادهای درخشان و دانش پژوهان جوان، آزمون پیشرفت تحصیلی ویژه مدارس استعدادهای درخشان را در دو مرحله به صورت هماهنگ برگزار می کند. در دستورالعمل برگزاری این آزمون آمده است: به منظور ارزیابی از میزان اثربخش بودن فرایند آموزش و میزان تحقق اهداف قصد شده برای برنامه های درسی و کیفیت بخشی به برنامه های علمی – آموزشی "آزمون پیشرفت تحصیلی" مدارس استعدادهای درخشان در دو مرحله و به صورت هماهنگ در تاریخ های 7/11/93 و 24/1/94 در پایه هفتم و هشتم دوره اول متوسطه و در پایه اول و دوم دوره دوم متوسطه، برگزار می شود.