به گزارش گروه سیاسی خبرگزاری برنا، متن نامه ظریف به شرح زیر است:
"سلام
با پوزش از تاخیر در پاسخ
از لطف شما و سایر دانش آموختگان بزرگوار دانشگاه امام صادق (ع) بسیار سپاسگزارم.
آن چه در دانشگاه اتفاق افتاد خلاف انتظار نبود و مرا زیاد ناراحت نکرد. توقع برخوردهای بسیار تندتر را داشتم و بسیاری به من توصیه کرده بودند که به مراسم نروم ولی نتوانستم خودم را راضی کنم.
قبلا هم که برای دیدار مرحوم آیت الله مهدوی کنی رضوان الله تعالی علیه به دانشگاه رفته بودم با برخورد مشابهی روبه‌رو شده بودم. لذا به این نوع مهرورزی‌ها که منحصر به دانشگاه امام صادق (ع) هم نیست عادت دارم.
البته محبت ویژه جناب دکتر سعید مهدوی و جناب میرلوحی بسیار دلگرم کننده و بسیار بیش از انتظار بنده بود.
نامه شما و دوستان نیز بنده را بیش از گذشته شرمنده بزرگواری شما و بقیه مردم خوب کشور کرد.
شاد و سربلند باشید."
لازم به ذکر است در جریان حضور محمد جواد ظریف در مراسم ختم مرحوم آقایی پور عده ای از دانشجویان دانشگاه امام صادق(ع) به او بی احترامی کردند که این اقدام با واکنش تند اساتید دانشگاه امام صادق(ع) مواجه شد. تعدادی از داشنجویان این دانشگاه نیز در نامه ای به وزیر امور خارجه اقدام اندک داشجویان دانشگاه امام صادق(ع) را نکوهش کردند.ظریف این نامه را در پاسخ به این دانشجویان نوشت.