علاقه امام(ره) به سید احمد خمینی و خانواده اش وصف ناشدنی بود. نقل قول های بسیاری در این خصوص از امام وجود دارد که یکی از مهمترین آنها دعای عمیق امام برای سید حسن، والدینش و برادرانش است. امروز و به مناسبت کاندیداتوری سید حسن خمینی در انتخابات خبرگان این دعا در شبکه های اجتماعی منتشر شده است.