به گزارش گروه بین الملل خبرگزاری برنا، نیویورک‌تایمز مدعی شد، شهرام امیری برای سیا جاسوسی می‌کرد. در سال 2009، سیا تصمیم گرفت که احتمال شناسایی وی زیاد است و پیشنهاد داد که او را از کشور خارج کند.
این روزنامه نوشت: سازمان به وی وعده 5 میلیون دلار پول و یک هویت جدید را داد. وی چندین سال جاسوس سازمان سیا در داخل ایران بود و درباره برنامه هسته‌ای کشور اطلاعات تهیه می‌کرد.