به گزارش گروه خبر خبرگزاری برنا، متن پیام آیت الله سید حسن خمینی به شرح زیر است:
«درگذشت نابهنگام آقای دکتر حسین اردستانی از رزمندگان جبهه‌های جنگ تحمیلی و از پیشتازان تاریخ‌نگاری صادقانه دفاع مقدس موجب تأسف و تأثر دوستداران ایشان گردید. اینجانب این ضایعه مولمه را به همسر گرامی و فرزندان عزیز آن مرحوم و نیز به همرزمان و همکاران ایشان تسلیت عرض نموده و از درگاه قادر متعال برای آن عزیز سفر کرده، حشر با امام و شهیدان مسئلت می‌نمایم.»